Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Scnn1bQ9WU38 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Scnn1bQ9WU38 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Scnn1bQ9WU38 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scnn1bQ9WU38 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Scnn1bQ9WU38 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Scnn1bQ9WU38 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scnn1bQ9WU38 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Scnn1bQ9WU38 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scnn1bQ9WU38 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scnn1bQ9WU38 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scnn1bQ9WU38 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scnn1bQ9WU38 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scnn1bQ9WU38 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scnn1bQ9WU38 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Scnn1bQ9WU38 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scnn1bQ9WU38 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scnn1bQ9WU38 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scnn1bQ9WU38 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scnn1bQ9WU38 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scnn1bQ9WU38 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scnn1bQ9WU38 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scnn1bQ9WU38 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scnn1bQ9WU38 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scnn1bQ9WU38 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scnn1bQ9WU38 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scnn1bQ9WU38 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scnn1bQ9WU38 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scnn1bQ9WU38 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scnn1bQ9WU38 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scnn1bQ9WU38 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Scnn1bQ9WU38 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Scnn1bQ9WU38 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Scnn1bQ9WU38 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scnn1bQ9WU38 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Scnn1bQ9WU38 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Scnn1bQ9WU38 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scnn1bQ9WU38 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scnn1bQ9WU38 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scnn1bQ9WU38 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scnn1bQ9WU38 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scnn1bQ9WU38 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scnn1bQ9WU38 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scnn1bQ9WU38 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scnn1bQ9WU38 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scnn1bQ9WU38 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scnn1bQ9WU38 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scnn1bQ9WU38 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scnn1bQ9WU38 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scnn1bQ9WU38 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Scnn1bQ9WU38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scnn1bQ9WU38 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scnn1bQ9WU38 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scnn1bQ9WU38 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scnn1bQ9WU38 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scnn1bQ9WU38 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scnn1bQ9WU38 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scnn1bQ9WU38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scnn1bQ9WU38 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scnn1bQ9WU38 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scnn1bQ9WU38 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scnn1bQ9WU38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scnn1bQ9WU38 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scnn1bQ9WU38 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scnn1bQ9WU38 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scnn1bQ9WU38 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scnn1bQ9WU38 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scnn1bQ9WU38 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scnn1bQ9WU38 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scnn1bQ9WU38 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scnn1bQ9WU38 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scnn1bQ9WU38 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scnn1bQ9WU38 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Scnn1bQ9WU38 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scnn1bQ9WU38 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scnn1bQ9WU38 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scnn1bQ9WU38 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scnn1bQ9WU38 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scnn1bQ9WU38 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scnn1bQ9WU38 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scnn1bQ9WU38 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms