Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trex2Q9R1A9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trex2Q9R1A9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trex2Q9R1A9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trex2Q9R1A9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trex2Q9R1A9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trex2Q9R1A9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trex2Q9R1A9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trex2Q9R1A9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trex2Q9R1A9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trex2Q9R1A9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trex2Q9R1A9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trex2Q9R1A9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trex2Q9R1A9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trex2Q9R1A9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trex2Q9R1A9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trex2Q9R1A9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trex2Q9R1A9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trex2Q9R1A9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trex2Q9R1A9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms