Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc6Q9R087 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc6Q9R087 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc6Q9R087 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc6Q9R087 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc6Q9R087 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc6Q9R087 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc6Q9R087 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc6Q9R087 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc6Q9R087 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc6Q9R087 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc6Q9R087 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc6Q9R087 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc6Q9R087 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc6Q9R087 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc6Q9R087 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc6Q9R087 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc6Q9R087 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpc6Q9R087 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc6Q9R087 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc6Q9R087 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc6Q9R087 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc6Q9R087 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpc6Q9R087 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc6Q9R087 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc6Q9R087 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc6Q9R087 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc6Q9R087 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc6Q9R087 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc6Q9R087 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc6Q9R087 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc6Q9R087 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc6Q9R087 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gpc6Q9R087 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc6Q9R087 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc6Q9R087 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc6Q9R087 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc6Q9R087 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc6Q9R087 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc6Q9R087 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpc6Q9R087 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpc6Q9R087 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc6Q9R087 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc6Q9R087 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc6Q9R087 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc6Q9R087 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc6Q9R087 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc6Q9R087 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc6Q9R087 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc6Q9R087 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc6Q9R087 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc6Q9R087 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc6Q9R087 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc6Q9R087 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc6Q9R087 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc6Q9R087 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc6Q9R087 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc6Q9R087 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc6Q9R087 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc6Q9R087 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc6Q9R087 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc6Q9R087 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc6Q9R087 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc6Q9R087 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc6Q9R087 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms