Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Exo1Q9QZ11 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Exo1Q9QZ11 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Exo1Q9QZ11 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Exo1Q9QZ11 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Exo1Q9QZ11 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Exo1Q9QZ11 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Exo1Q9QZ11 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Exo1Q9QZ11 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Exo1Q9QZ11 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Exo1Q9QZ11 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Exo1Q9QZ11 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Exo1Q9QZ11 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Exo1Q9QZ11 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Exo1Q9QZ11 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Exo1Q9QZ11 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Exo1Q9QZ11 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Exo1Q9QZ11 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Exo1Q9QZ11 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Exo1Q9QZ11 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Exo1Q9QZ11 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Exo1Q9QZ11 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Exo1Q9QZ11 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Exo1Q9QZ11 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Exo1Q9QZ11 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Exo1Q9QZ11 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Exo1Q9QZ11 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Exo1Q9QZ11 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Exo1Q9QZ11 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Exo1Q9QZ11 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Exo1Q9QZ11 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Exo1Q9QZ11 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Exo1Q9QZ11 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Exo1Q9QZ11 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Exo1Q9QZ11 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Exo1Q9QZ11 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Exo1Q9QZ11 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Exo1Q9QZ11 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exo1Q9QZ11 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Exo1Q9QZ11 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exo1Q9QZ11 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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