Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tlr4Q9QUK6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tlr4Q9QUK6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr4Q9QUK6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr4Q9QUK6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr4Q9QUK6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr4Q9QUK6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tlr4Q9QUK6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tlr4Q9QUK6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tlr4Q9QUK6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr4Q9QUK6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlr4Q9QUK6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlr4Q9QUK6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tlr4Q9QUK6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr4Q9QUK6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr4Q9QUK6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr4Q9QUK6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlr4Q9QUK6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlr4Q9QUK6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlr4Q9QUK6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr4Q9QUK6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr4Q9QUK6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr4Q9QUK6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr4Q9QUK6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr4Q9QUK6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr4Q9QUK6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tlr4Q9QUK6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tlr4Q9QUK6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr4Q9QUK6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr4Q9QUK6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr4Q9QUK6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr4Q9QUK6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr4Q9QUK6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlr4Q9QUK6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlr4Q9QUK6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tlr4Q9QUK6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tlr4Q9QUK6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr4Q9QUK6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr4Q9QUK6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tlr4Q9QUK6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr4Q9QUK6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr4Q9QUK6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr4Q9QUK6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr4Q9QUK6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr4Q9QUK6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr4Q9QUK6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr4Q9QUK6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr4Q9QUK6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr4Q9QUK6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr4Q9QUK6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr4Q9QUK6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr4Q9QUK6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr4Q9QUK6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr4Q9QUK6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr4Q9QUK6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr4Q9QUK6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr4Q9QUK6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr4Q9QUK6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr4Q9QUK6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr4Q9QUK6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr4Q9QUK6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr4Q9QUK6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr4Q9QUK6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlr4Q9QUK6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlr4Q9QUK6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlr4Q9QUK6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr4Q9QUK6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms