Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3glb1Q9JK48 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3glb1Q9JK48 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3glb1Q9JK48 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3glb1Q9JK48 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3glb1Q9JK48 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3glb1Q9JK48 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3glb1Q9JK48 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3glb1Q9JK48 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3glb1Q9JK48 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3glb1Q9JK48 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3glb1Q9JK48 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3glb1Q9JK48 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3glb1Q9JK48 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3glb1Q9JK48 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3glb1Q9JK48 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3glb1Q9JK48 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3glb1Q9JK48 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3glb1Q9JK48 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3glb1Q9JK48 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3glb1Q9JK48 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3glb1Q9JK48 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3glb1Q9JK48 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3glb1Q9JK48 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3glb1Q9JK48 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3glb1Q9JK48 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3glb1Q9JK48 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3glb1Q9JK48 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3glb1Q9JK48 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3glb1Q9JK48 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3glb1Q9JK48 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3glb1Q9JK48 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3glb1Q9JK48 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3glb1Q9JK48 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3glb1Q9JK48 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3glb1Q9JK48 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3glb1Q9JK48 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3glb1Q9JK48 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3glb1Q9JK48 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3glb1Q9JK48 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3glb1Q9JK48 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3glb1Q9JK48 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3glb1Q9JK48 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3glb1Q9JK48 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3glb1Q9JK48 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3glb1Q9JK48 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh3glb1Q9JK48 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3glb1Q9JK48 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3glb1Q9JK48 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3glb1Q9JK48 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3glb1Q9JK48 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3glb1Q9JK48 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3glb1Q9JK48 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3glb1Q9JK48 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3glb1Q9JK48 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3glb1Q9JK48 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3glb1Q9JK48 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3glb1Q9JK48 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3glb1Q9JK48 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3glb1Q9JK48 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3glb1Q9JK48 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3glb1Q9JK48 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3glb1Q9JK48 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3glb1Q9JK48 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3glb1Q9JK48 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3glb1Q9JK48 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3glb1Q9JK48 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133 ms