Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI91

Actn2, Alpha-actinin-2, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn2Q9JI91 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Actn2Q9JI91 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Actn2Q9JI91 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Actn2Q9JI91 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Actn2Q9JI91 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Actn2Q9JI91 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Actn2Q9JI91 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Actn2Q9JI91 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Actn2Q9JI91 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Actn2Q9JI91 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Actn2Q9JI91 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Actn2Q9JI91 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Actn2Q9JI91 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Actn2Q9JI91 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Actn2Q9JI91 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Actn2Q9JI91 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Actn2Q9JI91 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Actn2Q9JI91 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Actn2Q9JI91 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Actn2Q9JI91 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Actn2Q9JI91 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Actn2Q9JI91 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Actn2Q9JI91 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Actn2Q9JI91 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Actn2Q9JI91 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Actn2Q9JI91 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Actn2Q9JI91 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Actn2Q9JI91 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Actn2Q9JI91 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Actn2Q9JI91 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Actn2Q9JI91 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Actn2Q9JI91 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Actn2Q9JI91 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Actn2Q9JI91 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Actn2Q9JI91 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Actn2Q9JI91 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Actn2Q9JI91 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Actn2Q9JI91 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Actn2Q9JI91 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Actn2Q9JI91 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Actn2Q9JI91 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Actn2Q9JI91 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Actn2Q9JI91 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Actn2Q9JI91 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Actn2Q9JI91 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Actn2Q9JI91 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Actn2Q9JI91 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Actn2Q9JI91 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Actn2Q9JI91 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Actn2Q9JI91 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Actn2Q9JI91 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Actn2Q9JI91 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Actn2Q9JI91 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Actn2Q9JI91 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Actn2Q9JI91 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Actn2Q9JI91 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Actn2Q9JI91 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Actn2Q9JI91 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Actn2Q9JI91 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Actn2Q9JI91 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Actn2Q9JI91 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Actn2Q9JI91 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Actn2Q9JI91 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Actn2Q9JI91 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Actn2Q9JI91 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Actn2Q9JI91 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms