Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Htr3bQ9JHJ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Htr3bQ9JHJ5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htr3bQ9JHJ5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Htr3bQ9JHJ5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htr3bQ9JHJ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Htr3bQ9JHJ5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Htr3bQ9JHJ5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htr3bQ9JHJ5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htr3bQ9JHJ5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Htr3bQ9JHJ5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Htr3bQ9JHJ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htr3bQ9JHJ5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htr3bQ9JHJ5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htr3bQ9JHJ5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Htr3bQ9JHJ5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htr3bQ9JHJ5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htr3bQ9JHJ5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Htr3bQ9JHJ5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Htr3bQ9JHJ5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Htr3bQ9JHJ5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Htr3bQ9JHJ5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Htr3bQ9JHJ5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Htr3bQ9JHJ5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Htr3bQ9JHJ5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Htr3bQ9JHJ5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Htr3bQ9JHJ5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Htr3bQ9JHJ5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Htr3bQ9JHJ5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Htr3bQ9JHJ5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htr3bQ9JHJ5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Htr3bQ9JHJ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Htr3bQ9JHJ5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Htr3bQ9JHJ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Htr3bQ9JHJ5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Htr3bQ9JHJ5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Htr3bQ9JHJ5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htr3bQ9JHJ5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htr3bQ9JHJ5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htr3bQ9JHJ5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htr3bQ9JHJ5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Htr3bQ9JHJ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Htr3bQ9JHJ5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htr3bQ9JHJ5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Htr3bQ9JHJ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Htr3bQ9JHJ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htr3bQ9JHJ5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htr3bQ9JHJ5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htr3bQ9JHJ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htr3bQ9JHJ5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htr3bQ9JHJ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htr3bQ9JHJ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htr3bQ9JHJ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Htr3bQ9JHJ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Htr3bQ9JHJ5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Htr3bQ9JHJ5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htr3bQ9JHJ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Htr3bQ9JHJ5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Htr3bQ9JHJ5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Htr3bQ9JHJ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Htr3bQ9JHJ5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Htr3bQ9JHJ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htr3bQ9JHJ5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 288.7 ms