Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET78

Jph2, Junctophilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph2Q9ET78 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Jph2Q9ET78 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Jph2Q9ET78 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Jph2Q9ET78 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Jph2Q9ET78 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Jph2Q9ET78 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Jph2Q9ET78 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Jph2Q9ET78 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Jph2Q9ET78 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Jph2Q9ET78 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Jph2Q9ET78 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Jph2Q9ET78 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Jph2Q9ET78 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Jph2Q9ET78 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Jph2Q9ET78 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Jph2Q9ET78 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jph2Q9ET78 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Jph2Q9ET78 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Jph2Q9ET78 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Jph2Q9ET78 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Jph2Q9ET78 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Jph2Q9ET78 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Jph2Q9ET78 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Jph2Q9ET78 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Jph2Q9ET78 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Jph2Q9ET78 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Jph2Q9ET78 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Jph2Q9ET78 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Jph2Q9ET78 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Jph2Q9ET78 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Jph2Q9ET78 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Jph2Q9ET78 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Jph2Q9ET78 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Jph2Q9ET78 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Jph2Q9ET78 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Jph2Q9ET78 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Jph2Q9ET78 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Jph2Q9ET78 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Jph2Q9ET78 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Jph2Q9ET78 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Jph2Q9ET78 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Jph2Q9ET78 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Jph2Q9ET78 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Jph2Q9ET78 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Jph2Q9ET78 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Jph2Q9ET78 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Jph2Q9ET78 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jph2Q9ET78 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jph2Q9ET78 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jph2Q9ET78 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jph2Q9ET78 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jph2Q9ET78 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Jph2Q9ET78 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Jph2Q9ET78 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Jph2Q9ET78 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Jph2Q9ET78 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Jph2Q9ET78 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jph2Q9ET78 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Jph2Q9ET78 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Jph2Q9ET78 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms