Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
DysfQ9ESD7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
DysfQ9ESD7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
DysfQ9ESD7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
DysfQ9ESD7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
DysfQ9ESD7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21,99■■□□□ 1,11
DysfQ9ESD7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
DysfQ9ESD7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
DysfQ9ESD7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
DysfQ9ESD7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
DysfQ9ESD7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
DysfQ9ESD7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
DysfQ9ESD7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,93■■□□□ 1,1
DysfQ9ESD7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,93■■□□□ 1,1
DysfQ9ESD7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
DysfQ9ESD7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
DysfQ9ESD7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,89■■□□□ 1,1
DysfQ9ESD7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
DysfQ9ESD7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,88■■□□□ 1,09
DysfQ9ESD7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
DysfQ9ESD7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
DysfQ9ESD7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
DysfQ9ESD7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
DysfQ9ESD7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
DysfQ9ESD7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
DysfQ9ESD7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21,85■■□□□ 1,09
DysfQ9ESD7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
DysfQ9ESD7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,08
DysfQ9ESD7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21,82■■□□□ 1,08
DysfQ9ESD7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
DysfQ9ESD7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21,81■■□□□ 1,08
DysfQ9ESD7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21,78■■□□□ 1,08
DysfQ9ESD7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,78■■□□□ 1,08
DysfQ9ESD7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
DysfQ9ESD7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
DysfQ9ESD7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
DysfQ9ESD7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
DysfQ9ESD7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21,76■■□□□ 1,07
DysfQ9ESD7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
DysfQ9ESD7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
DysfQ9ESD7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21,75■■□□□ 1,07
DysfQ9ESD7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
DysfQ9ESD7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
DysfQ9ESD7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
DysfQ9ESD7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21,73■■□□□ 1,07
DysfQ9ESD7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
DysfQ9ESD7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
DysfQ9ESD7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21,71■■□□□ 1,07
DysfQ9ESD7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,71■■□□□ 1,07
DysfQ9ESD7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
DysfQ9ESD7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
DysfQ9ESD7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
DysfQ9ESD7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
DysfQ9ESD7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
DysfQ9ESD7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
DysfQ9ESD7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
DysfQ9ESD7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
DysfQ9ESD7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
DysfQ9ESD7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
DysfQ9ESD7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
DysfQ9ESD7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
DysfQ9ESD7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
DysfQ9ESD7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21,64■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,62■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21,6■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21,59■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21,59■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
DysfQ9ESD7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
DysfQ9ESD7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21,57■■□□□ 1,04
DysfQ9ESD7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21,56■■□□□ 1,04
DysfQ9ESD7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
DysfQ9ESD7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
DysfQ9ESD7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
DysfQ9ESD7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
DysfQ9ESD7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
DysfQ9ESD7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
DysfQ9ESD7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
DysfQ9ESD7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
DysfQ9ESD7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,52■■□□□ 1,04
DysfQ9ESD7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
DysfQ9ESD7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21,51■■□□□ 1,03
DysfQ9ESD7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
DysfQ9ESD7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
DysfQ9ESD7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
DysfQ9ESD7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
DysfQ9ESD7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21,49■■□□□ 1,03
DysfQ9ESD7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21,48■■□□□ 1,03
DysfQ9ESD7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
DysfQ9ESD7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,5 ms