Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ush1cQ9ES64 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ush1cQ9ES64 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ush1cQ9ES64 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ush1cQ9ES64 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ush1cQ9ES64 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ush1cQ9ES64 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ush1cQ9ES64 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ush1cQ9ES64 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ush1cQ9ES64 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ush1cQ9ES64 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ush1cQ9ES64 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ush1cQ9ES64 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ush1cQ9ES64 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ush1cQ9ES64 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ush1cQ9ES64 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ush1cQ9ES64 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ush1cQ9ES64 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ush1cQ9ES64 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ush1cQ9ES64 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ush1cQ9ES64 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ush1cQ9ES64 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ush1cQ9ES64 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ush1cQ9ES64 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ush1cQ9ES64 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ush1cQ9ES64 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ush1cQ9ES64 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ush1cQ9ES64 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ush1cQ9ES64 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ush1cQ9ES64 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ush1cQ9ES64 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ush1cQ9ES64 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ush1cQ9ES64 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ush1cQ9ES64 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ush1cQ9ES64 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ush1cQ9ES64 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ush1cQ9ES64 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ush1cQ9ES64 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ush1cQ9ES64 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ush1cQ9ES64 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ush1cQ9ES64 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ush1cQ9ES64 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ush1cQ9ES64 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ush1cQ9ES64 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ush1cQ9ES64 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ush1cQ9ES64 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ush1cQ9ES64 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ush1cQ9ES64 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ush1cQ9ES64 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ush1cQ9ES64 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ush1cQ9ES64 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ush1cQ9ES64 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ush1cQ9ES64 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ush1cQ9ES64 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ush1cQ9ES64 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ush1cQ9ES64 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ush1cQ9ES64 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ush1cQ9ES64 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ush1cQ9ES64 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ush1cQ9ES64 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ush1cQ9ES64 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ush1cQ9ES64 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ush1cQ9ES64 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ush1cQ9ES64 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ush1cQ9ES64 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ush1cQ9ES64 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ush1cQ9ES64 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ush1cQ9ES64 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ush1cQ9ES64 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ush1cQ9ES64 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ush1cQ9ES64 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ush1cQ9ES64 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ush1cQ9ES64 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ush1cQ9ES64 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ush1cQ9ES64 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ush1cQ9ES64 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ush1cQ9ES64 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ush1cQ9ES64 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ush1cQ9ES64 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ush1cQ9ES64 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ush1cQ9ES64 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ush1cQ9ES64 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ush1cQ9ES64 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ush1cQ9ES64 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ush1cQ9ES64 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ush1cQ9ES64 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ush1cQ9ES64 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms