Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER97

Ngb, Neuroglobin, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgbQ9ER97 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NgbQ9ER97 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NgbQ9ER97 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NgbQ9ER97 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NgbQ9ER97 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NgbQ9ER97 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NgbQ9ER97 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NgbQ9ER97 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NgbQ9ER97 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NgbQ9ER97 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NgbQ9ER97 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NgbQ9ER97 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NgbQ9ER97 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NgbQ9ER97 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NgbQ9ER97 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NgbQ9ER97 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NgbQ9ER97 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NgbQ9ER97 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NgbQ9ER97 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NgbQ9ER97 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NgbQ9ER97 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NgbQ9ER97 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NgbQ9ER97 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NgbQ9ER97 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NgbQ9ER97 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NgbQ9ER97 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NgbQ9ER97 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NgbQ9ER97 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NgbQ9ER97 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NgbQ9ER97 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NgbQ9ER97 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NgbQ9ER97 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NgbQ9ER97 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NgbQ9ER97 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NgbQ9ER97 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms