Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtp4Q9ER80 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtp4Q9ER80 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtp4Q9ER80 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rtp4Q9ER80 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtp4Q9ER80 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtp4Q9ER80 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtp4Q9ER80 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtp4Q9ER80 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtp4Q9ER80 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtp4Q9ER80 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtp4Q9ER80 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtp4Q9ER80 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtp4Q9ER80 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtp4Q9ER80 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtp4Q9ER80 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtp4Q9ER80 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtp4Q9ER80 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtp4Q9ER80 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtp4Q9ER80 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtp4Q9ER80 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtp4Q9ER80 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtp4Q9ER80 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtp4Q9ER80 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtp4Q9ER80 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms