Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER73

Elp4, Elongator complex protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp4Q9ER73 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elp4Q9ER73 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elp4Q9ER73 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elp4Q9ER73 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elp4Q9ER73 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Elp4Q9ER73 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Elp4Q9ER73 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elp4Q9ER73 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elp4Q9ER73 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Elp4Q9ER73 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Elp4Q9ER73 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elp4Q9ER73 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elp4Q9ER73 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elp4Q9ER73 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elp4Q9ER73 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elp4Q9ER73 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Elp4Q9ER73 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elp4Q9ER73 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Elp4Q9ER73 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Elp4Q9ER73 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Elp4Q9ER73 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Elp4Q9ER73 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp4Q9ER73 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp4Q9ER73 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp4Q9ER73 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Elp4Q9ER73 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Elp4Q9ER73 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Elp4Q9ER73 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Elp4Q9ER73 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms