Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCM4

Dnal4, Dynein light chain 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal4Q9DCM4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnal4Q9DCM4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnal4Q9DCM4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnal4Q9DCM4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnal4Q9DCM4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnal4Q9DCM4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnal4Q9DCM4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnal4Q9DCM4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnal4Q9DCM4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnal4Q9DCM4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnal4Q9DCM4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal4Q9DCM4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal4Q9DCM4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnal4Q9DCM4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnal4Q9DCM4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnal4Q9DCM4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnal4Q9DCM4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal4Q9DCM4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal4Q9DCM4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnal4Q9DCM4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnal4Q9DCM4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms