Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Erp27Q9D8U3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Erp27Q9D8U3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Erp27Q9D8U3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Erp27Q9D8U3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Erp27Q9D8U3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Erp27Q9D8U3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Erp27Q9D8U3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Erp27Q9D8U3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Erp27Q9D8U3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Erp27Q9D8U3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Erp27Q9D8U3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Erp27Q9D8U3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Erp27Q9D8U3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Erp27Q9D8U3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Erp27Q9D8U3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Erp27Q9D8U3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Erp27Q9D8U3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Erp27Q9D8U3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Erp27Q9D8U3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Erp27Q9D8U3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Erp27Q9D8U3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Erp27Q9D8U3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Erp27Q9D8U3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Erp27Q9D8U3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Erp27Q9D8U3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Erp27Q9D8U3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Erp27Q9D8U3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Erp27Q9D8U3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Erp27Q9D8U3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Erp27Q9D8U3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Erp27Q9D8U3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Erp27Q9D8U3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Erp27Q9D8U3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Erp27Q9D8U3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Erp27Q9D8U3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erp27Q9D8U3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Erp27Q9D8U3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erp27Q9D8U3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Erp27Q9D8U3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erp27Q9D8U3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erp27Q9D8U3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Erp27Q9D8U3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Erp27Q9D8U3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Erp27Q9D8U3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erp27Q9D8U3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erp27Q9D8U3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Erp27Q9D8U3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erp27Q9D8U3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Erp27Q9D8U3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Erp27Q9D8U3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Erp27Q9D8U3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Erp27Q9D8U3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Erp27Q9D8U3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Erp27Q9D8U3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Erp27Q9D8U3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Erp27Q9D8U3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms