Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AplfQ9D842 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AplfQ9D842 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AplfQ9D842 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AplfQ9D842 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AplfQ9D842 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AplfQ9D842 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AplfQ9D842 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AplfQ9D842 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AplfQ9D842 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AplfQ9D842 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AplfQ9D842 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AplfQ9D842 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AplfQ9D842 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AplfQ9D842 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AplfQ9D842 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AplfQ9D842 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AplfQ9D842 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AplfQ9D842 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AplfQ9D842 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AplfQ9D842 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AplfQ9D842 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AplfQ9D842 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AplfQ9D842 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AplfQ9D842 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AplfQ9D842 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AplfQ9D842 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AplfQ9D842 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AplfQ9D842 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AplfQ9D842 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AplfQ9D842 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AplfQ9D842 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AplfQ9D842 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AplfQ9D842 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AplfQ9D842 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AplfQ9D842 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AplfQ9D842 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms