Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Exosc8Q9D753 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Exosc8Q9D753 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Exosc8Q9D753 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Exosc8Q9D753 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Exosc8Q9D753 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Exosc8Q9D753 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Exosc8Q9D753 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Exosc8Q9D753 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Exosc8Q9D753 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Exosc8Q9D753 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Exosc8Q9D753 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Exosc8Q9D753 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Exosc8Q9D753 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Exosc8Q9D753 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Exosc8Q9D753 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Exosc8Q9D753 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Exosc8Q9D753 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Exosc8Q9D753 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Exosc8Q9D753 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Exosc8Q9D753 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Exosc8Q9D753 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Exosc8Q9D753 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Exosc8Q9D753 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Exosc8Q9D753 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Exosc8Q9D753 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Exosc8Q9D753 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Exosc8Q9D753 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Exosc8Q9D753 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Exosc8Q9D753 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Exosc8Q9D753 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Exosc8Q9D753 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Exosc8Q9D753 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Exosc8Q9D753 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Exosc8Q9D753 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Exosc8Q9D753 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Exosc8Q9D753 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Exosc8Q9D753 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Exosc8Q9D753 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Exosc8Q9D753 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Exosc8Q9D753 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Exosc8Q9D753 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Exosc8Q9D753 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Exosc8Q9D753 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exosc8Q9D753 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Exosc8Q9D753 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Exosc8Q9D753 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Exosc8Q9D753 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc8Q9D753 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc8Q9D753 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc8Q9D753 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc8Q9D753 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc8Q9D753 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc8Q9D753 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc8Q9D753 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Exosc8Q9D753 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Exosc8Q9D753 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exosc8Q9D753 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exosc8Q9D753 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Exosc8Q9D753 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exosc8Q9D753 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc8Q9D753 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms