Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tube1Q9D6T1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tube1Q9D6T1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tube1Q9D6T1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tube1Q9D6T1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tube1Q9D6T1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tube1Q9D6T1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tube1Q9D6T1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tube1Q9D6T1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Tube1Q9D6T1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tube1Q9D6T1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tube1Q9D6T1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tube1Q9D6T1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tube1Q9D6T1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tube1Q9D6T1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tube1Q9D6T1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tube1Q9D6T1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tube1Q9D6T1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tube1Q9D6T1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tube1Q9D6T1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tube1Q9D6T1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tube1Q9D6T1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tube1Q9D6T1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tube1Q9D6T1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tube1Q9D6T1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tube1Q9D6T1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tube1Q9D6T1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Tube1Q9D6T1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tube1Q9D6T1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tube1Q9D6T1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tube1Q9D6T1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tube1Q9D6T1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tube1Q9D6T1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tube1Q9D6T1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tube1Q9D6T1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tube1Q9D6T1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tube1Q9D6T1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tube1Q9D6T1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tube1Q9D6T1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tube1Q9D6T1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tube1Q9D6T1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tube1Q9D6T1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tube1Q9D6T1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tube1Q9D6T1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tube1Q9D6T1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tube1Q9D6T1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tube1Q9D6T1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tube1Q9D6T1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tube1Q9D6T1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tube1Q9D6T1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tube1Q9D6T1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tube1Q9D6T1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tube1Q9D6T1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tube1Q9D6T1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tube1Q9D6T1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tube1Q9D6T1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tube1Q9D6T1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tube1Q9D6T1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tube1Q9D6T1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tube1Q9D6T1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tube1Q9D6T1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tube1Q9D6T1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tube1Q9D6T1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tube1Q9D6T1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tube1Q9D6T1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tube1Q9D6T1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tube1Q9D6T1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tube1Q9D6T1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tube1Q9D6T1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tube1Q9D6T1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tube1Q9D6T1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tube1Q9D6T1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tube1Q9D6T1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tube1Q9D6T1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tube1Q9D6T1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tube1Q9D6T1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tube1Q9D6T1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tube1Q9D6T1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tube1Q9D6T1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tube1Q9D6T1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tube1Q9D6T1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tube1Q9D6T1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tube1Q9D6T1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms