Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp6v1e2Q9D593 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp6v1e2Q9D593 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp6v1e2Q9D593 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp6v1e2Q9D593 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp6v1e2Q9D593 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp6v1e2Q9D593 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp6v1e2Q9D593 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp6v1e2Q9D593 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp6v1e2Q9D593 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp6v1e2Q9D593 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp6v1e2Q9D593 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp6v1e2Q9D593 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp6v1e2Q9D593 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp6v1e2Q9D593 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp6v1e2Q9D593 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp6v1e2Q9D593 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp6v1e2Q9D593 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp6v1e2Q9D593 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Atp6v1e2Q9D593 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp6v1e2Q9D593 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp6v1e2Q9D593 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp6v1e2Q9D593 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp6v1e2Q9D593 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp6v1e2Q9D593 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp6v1e2Q9D593 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atp6v1e2Q9D593 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp6v1e2Q9D593 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp6v1e2Q9D593 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atp6v1e2Q9D593 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp6v1e2Q9D593 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atp6v1e2Q9D593 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atp6v1e2Q9D593 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atp6v1e2Q9D593 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp6v1e2Q9D593 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp6v1e2Q9D593 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp6v1e2Q9D593 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp6v1e2Q9D593 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp6v1e2Q9D593 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atp6v1e2Q9D593 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atp6v1e2Q9D593 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atp6v1e2Q9D593 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp6v1e2Q9D593 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atp6v1e2Q9D593 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp6v1e2Q9D593 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp6v1e2Q9D593 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp6v1e2Q9D593 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp6v1e2Q9D593 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp6v1e2Q9D593 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp6v1e2Q9D593 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp6v1e2Q9D593 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp6v1e2Q9D593 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp6v1e2Q9D593 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp6v1e2Q9D593 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp6v1e2Q9D593 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp6v1e2Q9D593 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp6v1e2Q9D593 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp6v1e2Q9D593 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp6v1e2Q9D593 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp6v1e2Q9D593 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp6v1e2Q9D593 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp6v1e2Q9D593 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp6v1e2Q9D593 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp6v1e2Q9D593 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp6v1e2Q9D593 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp6v1e2Q9D593 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp6v1e2Q9D593 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Atp6v1e2Q9D593 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp6v1e2Q9D593 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp6v1e2Q9D593 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp6v1e2Q9D593 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp6v1e2Q9D593 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp6v1e2Q9D593 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp6v1e2Q9D593 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms