Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ubxn11Q9D572 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ubxn11Q9D572 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ubxn11Q9D572 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ubxn11Q9D572 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ubxn11Q9D572 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ubxn11Q9D572 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ubxn11Q9D572 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubxn11Q9D572 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ubxn11Q9D572 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ubxn11Q9D572 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ubxn11Q9D572 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ubxn11Q9D572 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ubxn11Q9D572 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ubxn11Q9D572 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ubxn11Q9D572 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ubxn11Q9D572 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ubxn11Q9D572 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ubxn11Q9D572 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn11Q9D572 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ubxn11Q9D572 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubxn11Q9D572 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ubxn11Q9D572 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ubxn11Q9D572 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ubxn11Q9D572 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn11Q9D572 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ubxn11Q9D572 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubxn11Q9D572 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ubxn11Q9D572 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ubxn11Q9D572 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ubxn11Q9D572 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ubxn11Q9D572 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubxn11Q9D572 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ubxn11Q9D572 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ubxn11Q9D572 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubxn11Q9D572 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubxn11Q9D572 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ubxn11Q9D572 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubxn11Q9D572 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ubxn11Q9D572 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ubxn11Q9D572 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubxn11Q9D572 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ubxn11Q9D572 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ubxn11Q9D572 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ubxn11Q9D572 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubxn11Q9D572 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ubxn11Q9D572 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubxn11Q9D572 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubxn11Q9D572 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ubxn11Q9D572 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ubxn11Q9D572 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubxn11Q9D572 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ubxn11Q9D572 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubxn11Q9D572 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ubxn11Q9D572 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ubxn11Q9D572 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubxn11Q9D572 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubxn11Q9D572 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ubxn11Q9D572 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubxn11Q9D572 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubxn11Q9D572 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubxn11Q9D572 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ubxn11Q9D572 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubxn11Q9D572 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ubxn11Q9D572 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubxn11Q9D572 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubxn11Q9D572 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ubxn11Q9D572 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubxn11Q9D572 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubxn11Q9D572 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubxn11Q9D572 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubxn11Q9D572 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubxn11Q9D572 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubxn11Q9D572 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ubxn11Q9D572 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ubxn11Q9D572 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ubxn11Q9D572 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ubxn11Q9D572 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ubxn11Q9D572 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ubxn11Q9D572 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ubxn11Q9D572 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ubxn11Q9D572 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ubxn11Q9D572 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ubxn11Q9D572 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ubxn11Q9D572 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ubxn11Q9D572 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ubxn11Q9D572 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ubxn11Q9D572 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ubxn11Q9D572 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubxn11Q9D572 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubxn11Q9D572 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubxn11Q9D572 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubxn11Q9D572 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubxn11Q9D572 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubxn11Q9D572 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubxn11Q9D572 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubxn11Q9D572 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubxn11Q9D572 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubxn11Q9D572 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ubxn11Q9D572 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms