Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc130Q9D516 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc130Q9D516 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc130Q9D516 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc130Q9D516 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc130Q9D516 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc130Q9D516 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc130Q9D516 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc130Q9D516 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc130Q9D516 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc130Q9D516 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc130Q9D516 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc130Q9D516 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc130Q9D516 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc130Q9D516 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc130Q9D516 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc130Q9D516 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc130Q9D516 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc130Q9D516 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc130Q9D516 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc130Q9D516 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc130Q9D516 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc130Q9D516 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc130Q9D516 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc130Q9D516 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc130Q9D516 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc130Q9D516 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc130Q9D516 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc130Q9D516 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc130Q9D516 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc130Q9D516 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc130Q9D516 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc130Q9D516 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc130Q9D516 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc130Q9D516 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc130Q9D516 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc130Q9D516 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc130Q9D516 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc130Q9D516 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc130Q9D516 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc130Q9D516 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc130Q9D516 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc130Q9D516 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc130Q9D516 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc130Q9D516 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc130Q9D516 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc130Q9D516 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc130Q9D516 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc130Q9D516 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc130Q9D516 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc130Q9D516 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc130Q9D516 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc130Q9D516 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc130Q9D516 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc130Q9D516 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms