Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx11Q9D3G5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx11Q9D3G5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx11Q9D3G5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx11Q9D3G5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx11Q9D3G5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx11Q9D3G5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx11Q9D3G5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx11Q9D3G5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx11Q9D3G5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx11Q9D3G5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx11Q9D3G5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx11Q9D3G5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx11Q9D3G5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx11Q9D3G5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx11Q9D3G5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx11Q9D3G5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx11Q9D3G5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx11Q9D3G5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx11Q9D3G5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx11Q9D3G5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx11Q9D3G5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx11Q9D3G5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx11Q9D3G5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx11Q9D3G5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx11Q9D3G5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx11Q9D3G5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx11Q9D3G5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx11Q9D3G5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stx11Q9D3G5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stx11Q9D3G5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx11Q9D3G5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx11Q9D3G5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx11Q9D3G5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx11Q9D3G5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx11Q9D3G5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx11Q9D3G5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stx11Q9D3G5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx11Q9D3G5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx11Q9D3G5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx11Q9D3G5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stx11Q9D3G5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stx11Q9D3G5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx11Q9D3G5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx11Q9D3G5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms