Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Snx20Q9D2Y5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx20Q9D2Y5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx20Q9D2Y5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx20Q9D2Y5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx20Q9D2Y5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx20Q9D2Y5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx20Q9D2Y5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx20Q9D2Y5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx20Q9D2Y5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx20Q9D2Y5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx20Q9D2Y5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx20Q9D2Y5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx20Q9D2Y5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx20Q9D2Y5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx20Q9D2Y5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx20Q9D2Y5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx20Q9D2Y5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx20Q9D2Y5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx20Q9D2Y5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx20Q9D2Y5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx20Q9D2Y5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx20Q9D2Y5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx20Q9D2Y5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx20Q9D2Y5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx20Q9D2Y5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx20Q9D2Y5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx20Q9D2Y5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx20Q9D2Y5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx20Q9D2Y5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx20Q9D2Y5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx20Q9D2Y5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx20Q9D2Y5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx20Q9D2Y5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx20Q9D2Y5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx20Q9D2Y5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx20Q9D2Y5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx20Q9D2Y5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx20Q9D2Y5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx20Q9D2Y5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx20Q9D2Y5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx20Q9D2Y5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx20Q9D2Y5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx20Q9D2Y5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx20Q9D2Y5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx20Q9D2Y5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx20Q9D2Y5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx20Q9D2Y5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx20Q9D2Y5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx20Q9D2Y5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx20Q9D2Y5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx20Q9D2Y5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx20Q9D2Y5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx20Q9D2Y5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx20Q9D2Y5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx20Q9D2Y5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx20Q9D2Y5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx20Q9D2Y5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx20Q9D2Y5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms