Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srfbp1Q9CZ91 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srfbp1Q9CZ91 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srfbp1Q9CZ91 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srfbp1Q9CZ91 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srfbp1Q9CZ91 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srfbp1Q9CZ91 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srfbp1Q9CZ91 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Srfbp1Q9CZ91 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srfbp1Q9CZ91 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srfbp1Q9CZ91 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srfbp1Q9CZ91 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srfbp1Q9CZ91 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srfbp1Q9CZ91 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srfbp1Q9CZ91 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srfbp1Q9CZ91 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srfbp1Q9CZ91 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srfbp1Q9CZ91 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srfbp1Q9CZ91 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srfbp1Q9CZ91 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srfbp1Q9CZ91 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srfbp1Q9CZ91 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srfbp1Q9CZ91 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srfbp1Q9CZ91 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srfbp1Q9CZ91 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srfbp1Q9CZ91 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srfbp1Q9CZ91 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Srfbp1Q9CZ91 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srfbp1Q9CZ91 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srfbp1Q9CZ91 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srfbp1Q9CZ91 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Srfbp1Q9CZ91 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srfbp1Q9CZ91 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srfbp1Q9CZ91 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srfbp1Q9CZ91 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srfbp1Q9CZ91 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srfbp1Q9CZ91 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srfbp1Q9CZ91 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srfbp1Q9CZ91 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srfbp1Q9CZ91 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srfbp1Q9CZ91 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srfbp1Q9CZ91 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srfbp1Q9CZ91 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srfbp1Q9CZ91 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srfbp1Q9CZ91 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srfbp1Q9CZ91 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srfbp1Q9CZ91 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srfbp1Q9CZ91 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srfbp1Q9CZ91 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srfbp1Q9CZ91 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.7 ms