Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX45

8030423J24Rik, MCG54345, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030423J24RikQ9CX45 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
8030423J24RikQ9CX45 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
8030423J24RikQ9CX45 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
8030423J24RikQ9CX45 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
8030423J24RikQ9CX45 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030423J24RikQ9CX45 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030423J24RikQ9CX45 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030423J24RikQ9CX45 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
8030423J24RikQ9CX45 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
8030423J24RikQ9CX45 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
8030423J24RikQ9CX45 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
8030423J24RikQ9CX45 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
8030423J24RikQ9CX45 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
8030423J24RikQ9CX45 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
8030423J24RikQ9CX45 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
8030423J24RikQ9CX45 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
8030423J24RikQ9CX45 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030423J24RikQ9CX45 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
8030423J24RikQ9CX45 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
8030423J24RikQ9CX45 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
8030423J24RikQ9CX45 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
8030423J24RikQ9CX45 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
8030423J24RikQ9CX45 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
8030423J24RikQ9CX45 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
8030423J24RikQ9CX45 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
8030423J24RikQ9CX45 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
8030423J24RikQ9CX45 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
8030423J24RikQ9CX45 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030423J24RikQ9CX45 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030423J24RikQ9CX45 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030423J24RikQ9CX45 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030423J24RikQ9CX45 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
8030423J24RikQ9CX45 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
8030423J24RikQ9CX45 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
8030423J24RikQ9CX45 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
8030423J24RikQ9CX45 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
8030423J24RikQ9CX45 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
8030423J24RikQ9CX45 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
8030423J24RikQ9CX45 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
8030423J24RikQ9CX45 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
8030423J24RikQ9CX45 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
8030423J24RikQ9CX45 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030423J24RikQ9CX45 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030423J24RikQ9CX45 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030423J24RikQ9CX45 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
8030423J24RikQ9CX45 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
8030423J24RikQ9CX45 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
8030423J24RikQ9CX45 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
8030423J24RikQ9CX45 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
8030423J24RikQ9CX45 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms