Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930519P11RikQ9CUJ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930519P11RikQ9CUJ8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930519P11RikQ9CUJ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930519P11RikQ9CUJ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930519P11RikQ9CUJ8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930519P11RikQ9CUJ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930519P11RikQ9CUJ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4930519P11RikQ9CUJ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930519P11RikQ9CUJ8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930519P11RikQ9CUJ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms