Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pole4Q9CQ36 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pole4Q9CQ36 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pole4Q9CQ36 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pole4Q9CQ36 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pole4Q9CQ36 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pole4Q9CQ36 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pole4Q9CQ36 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pole4Q9CQ36 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pole4Q9CQ36 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pole4Q9CQ36 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pole4Q9CQ36 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pole4Q9CQ36 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pole4Q9CQ36 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pole4Q9CQ36 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pole4Q9CQ36 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pole4Q9CQ36 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pole4Q9CQ36 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pole4Q9CQ36 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pole4Q9CQ36 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pole4Q9CQ36 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pole4Q9CQ36 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pole4Q9CQ36 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pole4Q9CQ36 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pole4Q9CQ36 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pole4Q9CQ36 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pole4Q9CQ36 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pole4Q9CQ36 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pole4Q9CQ36 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pole4Q9CQ36 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pole4Q9CQ36 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pole4Q9CQ36 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pole4Q9CQ36 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pole4Q9CQ36 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pole4Q9CQ36 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pole4Q9CQ36 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pole4Q9CQ36 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pole4Q9CQ36 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pole4Q9CQ36 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pole4Q9CQ36 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pole4Q9CQ36 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pole4Q9CQ36 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pole4Q9CQ36 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pole4Q9CQ36 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pole4Q9CQ36 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pole4Q9CQ36 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pole4Q9CQ36 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pole4Q9CQ36 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pole4Q9CQ36 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pole4Q9CQ36 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pole4Q9CQ36 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pole4Q9CQ36 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pole4Q9CQ36 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pole4Q9CQ36 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pole4Q9CQ36 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pole4Q9CQ36 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pole4Q9CQ36 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pole4Q9CQ36 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pole4Q9CQ36 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pole4Q9CQ36 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pole4Q9CQ36 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pole4Q9CQ36 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pole4Q9CQ36 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pole4Q9CQ36 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pole4Q9CQ36 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pole4Q9CQ36 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pole4Q9CQ36 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pole4Q9CQ36 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pole4Q9CQ36 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pole4Q9CQ36 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pole4Q9CQ36 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pole4Q9CQ36 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pole4Q9CQ36 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pole4Q9CQ36 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pole4Q9CQ36 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pole4Q9CQ36 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pole4Q9CQ36 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pole4Q9CQ36 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pole4Q9CQ36 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pole4Q9CQ36 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pole4Q9CQ36 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pole4Q9CQ36 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pole4Q9CQ36 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pole4Q9CQ36 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pole4Q9CQ36 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pole4Q9CQ36 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pole4Q9CQ36 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms