Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
4930550L24RikQ99PA7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930550L24RikQ99PA7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
4930550L24RikQ99PA7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
4930550L24RikQ99PA7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930550L24RikQ99PA7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930550L24RikQ99PA7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930550L24RikQ99PA7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930550L24RikQ99PA7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930550L24RikQ99PA7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930550L24RikQ99PA7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930550L24RikQ99PA7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930550L24RikQ99PA7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930550L24RikQ99PA7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930550L24RikQ99PA7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930550L24RikQ99PA7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930550L24RikQ99PA7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930550L24RikQ99PA7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930550L24RikQ99PA7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930550L24RikQ99PA7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930550L24RikQ99PA7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930550L24RikQ99PA7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930550L24RikQ99PA7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930550L24RikQ99PA7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930550L24RikQ99PA7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930550L24RikQ99PA7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
4930550L24RikQ99PA7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930550L24RikQ99PA7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930550L24RikQ99PA7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
4930550L24RikQ99PA7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930550L24RikQ99PA7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930550L24RikQ99PA7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930550L24RikQ99PA7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930550L24RikQ99PA7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930550L24RikQ99PA7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930550L24RikQ99PA7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930550L24RikQ99PA7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930550L24RikQ99PA7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930550L24RikQ99PA7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930550L24RikQ99PA7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930550L24RikQ99PA7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930550L24RikQ99PA7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930550L24RikQ99PA7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930550L24RikQ99PA7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930550L24RikQ99PA7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930550L24RikQ99PA7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930550L24RikQ99PA7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930550L24RikQ99PA7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930550L24RikQ99PA7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930550L24RikQ99PA7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
4930550L24RikQ99PA7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930550L24RikQ99PA7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930550L24RikQ99PA7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930550L24RikQ99PA7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930550L24RikQ99PA7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930550L24RikQ99PA7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930550L24RikQ99PA7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930550L24RikQ99PA7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930550L24RikQ99PA7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930550L24RikQ99PA7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930550L24RikQ99PA7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930550L24RikQ99PA7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930550L24RikQ99PA7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
4930550L24RikQ99PA7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930550L24RikQ99PA7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930550L24RikQ99PA7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930550L24RikQ99PA7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930550L24RikQ99PA7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930550L24RikQ99PA7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930550L24RikQ99PA7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930550L24RikQ99PA7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930550L24RikQ99PA7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930550L24RikQ99PA7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930550L24RikQ99PA7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
4930550L24RikQ99PA7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930550L24RikQ99PA7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930550L24RikQ99PA7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930550L24RikQ99PA7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930550L24RikQ99PA7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930550L24RikQ99PA7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930550L24RikQ99PA7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
4930550L24RikQ99PA7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms