Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmp1Q99KU0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmp1Q99KU0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmp1Q99KU0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmp1Q99KU0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmp1Q99KU0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmp1Q99KU0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Vmp1Q99KU0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmp1Q99KU0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmp1Q99KU0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmp1Q99KU0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmp1Q99KU0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmp1Q99KU0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmp1Q99KU0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmp1Q99KU0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmp1Q99KU0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmp1Q99KU0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmp1Q99KU0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmp1Q99KU0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmp1Q99KU0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmp1Q99KU0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmp1Q99KU0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmp1Q99KU0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmp1Q99KU0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmp1Q99KU0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmp1Q99KU0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmp1Q99KU0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmp1Q99KU0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmp1Q99KU0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmp1Q99KU0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmp1Q99KU0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmp1Q99KU0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmp1Q99KU0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmp1Q99KU0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmp1Q99KU0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmp1Q99KU0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmp1Q99KU0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms