Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp11Q99K46 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp11Q99K46 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp11Q99K46 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp11Q99K46 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp11Q99K46 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp11Q99K46 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp11Q99K46 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp11Q99K46 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp11Q99K46 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp11Q99K46 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp11Q99K46 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp11Q99K46 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp11Q99K46 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp11Q99K46 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp11Q99K46 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp11Q99K46 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp11Q99K46 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp11Q99K46 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp11Q99K46 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp11Q99K46 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp11Q99K46 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Usp11Q99K46 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp11Q99K46 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp11Q99K46 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp11Q99K46 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp11Q99K46 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp11Q99K46 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp11Q99K46 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp11Q99K46 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp11Q99K46 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp11Q99K46 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp11Q99K46 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp11Q99K46 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp11Q99K46 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp11Q99K46 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp11Q99K46 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp11Q99K46 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp11Q99K46 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp11Q99K46 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp11Q99K46 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp11Q99K46 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp11Q99K46 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp11Q99K46 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp11Q99K46 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp11Q99K46 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp11Q99K46 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp11Q99K46 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp11Q99K46 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp11Q99K46 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp11Q99K46 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp11Q99K46 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp11Q99K46 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp11Q99K46 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp11Q99K46 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp11Q99K46 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp11Q99K46 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp11Q99K46 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp11Q99K46 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp11Q99K46 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp11Q99K46 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp11Q99K46 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp11Q99K46 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp11Q99K46 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp11Q99K46 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp11Q99K46 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp11Q99K46 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp11Q99K46 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms