Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ophn1Q99J31 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ophn1Q99J31 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ophn1Q99J31 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ophn1Q99J31 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ophn1Q99J31 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ophn1Q99J31 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ophn1Q99J31 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ophn1Q99J31 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ophn1Q99J31 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ophn1Q99J31 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ophn1Q99J31 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ophn1Q99J31 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ophn1Q99J31 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ophn1Q99J31 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ophn1Q99J31 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ophn1Q99J31 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ophn1Q99J31 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ophn1Q99J31 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ophn1Q99J31 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ophn1Q99J31 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ophn1Q99J31 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ophn1Q99J31 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ophn1Q99J31 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ophn1Q99J31 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ophn1Q99J31 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ophn1Q99J31 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ophn1Q99J31 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ophn1Q99J31 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ophn1Q99J31 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ophn1Q99J31 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ophn1Q99J31 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ophn1Q99J31 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ophn1Q99J31 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ophn1Q99J31 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ophn1Q99J31 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ophn1Q99J31 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ophn1Q99J31 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ophn1Q99J31 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ophn1Q99J31 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ophn1Q99J31 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ophn1Q99J31 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ophn1Q99J31 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ophn1Q99J31 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ophn1Q99J31 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ophn1Q99J31 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ophn1Q99J31 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ophn1Q99J31 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ophn1Q99J31 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ophn1Q99J31 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ophn1Q99J31 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ophn1Q99J31 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ophn1Q99J31 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ophn1Q99J31 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ophn1Q99J31 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ophn1Q99J31 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ophn1Q99J31 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ophn1Q99J31 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ophn1Q99J31 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ophn1Q99J31 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ophn1Q99J31 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ophn1Q99J31 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ophn1Q99J31 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ophn1Q99J31 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ophn1Q99J31 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ophn1Q99J31 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ophn1Q99J31 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ophn1Q99J31 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ophn1Q99J31 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ophn1Q99J31 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ophn1Q99J31 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ophn1Q99J31 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ophn1Q99J31 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ophn1Q99J31 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ophn1Q99J31 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ophn1Q99J31 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ophn1Q99J31 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ophn1Q99J31 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ophn1Q99J31 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ophn1Q99J31 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ophn1Q99J31 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ophn1Q99J31 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ophn1Q99J31 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ophn1Q99J31 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ophn1Q99J31 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ophn1Q99J31 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ophn1Q99J31 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ophn1Q99J31 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ophn1Q99J31 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ophn1Q99J31 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ophn1Q99J31 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ophn1Q99J31 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ophn1Q99J31 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ophn1Q99J31 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ophn1Q99J31 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ophn1Q99J31 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ophn1Q99J31 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ophn1Q99J31 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ophn1Q99J31 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ophn1Q99J31 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms