Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf4Q8VI88 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf4Q8VI88 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf4Q8VI88 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf4Q8VI88 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf4Q8VI88 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf4Q8VI88 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf4Q8VI88 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf4Q8VI88 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf4Q8VI88 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf4Q8VI88 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf4Q8VI88 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf4Q8VI88 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Odf4Q8VI88 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Odf4Q8VI88 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Odf4Q8VI88 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Odf4Q8VI88 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Odf4Q8VI88 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf4Q8VI88 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf4Q8VI88 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Odf4Q8VI88 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Odf4Q8VI88 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odf4Q8VI88 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odf4Q8VI88 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Odf4Q8VI88 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Odf4Q8VI88 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Odf4Q8VI88 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Odf4Q8VI88 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Odf4Q8VI88 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Odf4Q8VI88 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf4Q8VI88 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf4Q8VI88 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf4Q8VI88 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Odf4Q8VI88 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Odf4Q8VI88 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Odf4Q8VI88 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Odf4Q8VI88 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odf4Q8VI88 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odf4Q8VI88 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odf4Q8VI88 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Odf4Q8VI88 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Odf4Q8VI88 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Odf4Q8VI88 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf4Q8VI88 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Odf4Q8VI88 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Odf4Q8VI88 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf4Q8VI88 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf4Q8VI88 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf4Q8VI88 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Odf4Q8VI88 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf4Q8VI88 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf4Q8VI88 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Odf4Q8VI88 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms