Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cd300ldQ8VCH2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd300ldQ8VCH2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd300ldQ8VCH2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cd300ldQ8VCH2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cd300ldQ8VCH2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd300ldQ8VCH2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cd300ldQ8VCH2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cd300ldQ8VCH2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cd300ldQ8VCH2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cd300ldQ8VCH2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cd300ldQ8VCH2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cd300ldQ8VCH2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cd300ldQ8VCH2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd300ldQ8VCH2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd300ldQ8VCH2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cd300ldQ8VCH2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cd300ldQ8VCH2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cd300ldQ8VCH2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cd300ldQ8VCH2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cd300ldQ8VCH2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cd300ldQ8VCH2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cd300ldQ8VCH2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cd300ldQ8VCH2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cd300ldQ8VCH2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cd300ldQ8VCH2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cd300ldQ8VCH2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cd300ldQ8VCH2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cd300ldQ8VCH2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cd300ldQ8VCH2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cd300ldQ8VCH2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cd300ldQ8VCH2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cd300ldQ8VCH2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cd300ldQ8VCH2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cd300ldQ8VCH2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cd300ldQ8VCH2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cd300ldQ8VCH2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cd300ldQ8VCH2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cd300ldQ8VCH2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cd300ldQ8VCH2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cd300ldQ8VCH2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cd300ldQ8VCH2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cd300ldQ8VCH2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cd300ldQ8VCH2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cd300ldQ8VCH2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cd300ldQ8VCH2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cd300ldQ8VCH2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cd300ldQ8VCH2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cd300ldQ8VCH2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cd300ldQ8VCH2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cd300ldQ8VCH2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cd300ldQ8VCH2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cd300ldQ8VCH2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cd300ldQ8VCH2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cd300ldQ8VCH2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cd300ldQ8VCH2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cd300ldQ8VCH2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms