Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Slc9a8Q8R4D1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Slc9a8Q8R4D1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Slc9a8Q8R4D1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Slc9a8Q8R4D1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Slc9a8Q8R4D1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Slc9a8Q8R4D1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Slc9a8Q8R4D1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Slc9a8Q8R4D1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Slc9a8Q8R4D1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Slc9a8Q8R4D1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Slc9a8Q8R4D1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Slc9a8Q8R4D1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Slc9a8Q8R4D1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Slc9a8Q8R4D1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Slc9a8Q8R4D1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Slc9a8Q8R4D1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Slc9a8Q8R4D1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Slc9a8Q8R4D1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Slc9a8Q8R4D1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23,13■■□□□ 1,29
Slc9a8Q8R4D1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Slc9a8Q8R4D1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Slc9a8Q8R4D1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23,11■■□□□ 1,29
Slc9a8Q8R4D1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Slc9a8Q8R4D1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Slc9a8Q8R4D1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Slc9a8Q8R4D1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Slc9a8Q8R4D1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Slc9a8Q8R4D1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Slc9a8Q8R4D1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
Slc9a8Q8R4D1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Slc9a8Q8R4D1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Slc9a8Q8R4D1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Slc9a8Q8R4D1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Slc9a8Q8R4D1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Slc9a8Q8R4D1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Slc9a8Q8R4D1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Slc9a8Q8R4D1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Slc9a8Q8R4D1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Slc9a8Q8R4D1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Slc9a8Q8R4D1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Slc9a8Q8R4D1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Slc9a8Q8R4D1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Slc9a8Q8R4D1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Slc9a8Q8R4D1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Slc9a8Q8R4D1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Slc9a8Q8R4D1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22,94■■□□□ 1,26
Slc9a8Q8R4D1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Slc9a8Q8R4D1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Slc9a8Q8R4D1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Slc9a8Q8R4D1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Slc9a8Q8R4D1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22,92■■□□□ 1,26
Slc9a8Q8R4D1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Slc9a8Q8R4D1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,92■■□□□ 1,26
Slc9a8Q8R4D1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Slc9a8Q8R4D1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Slc9a8Q8R4D1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,89■■□□□ 1,26
Slc9a8Q8R4D1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Slc9a8Q8R4D1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Slc9a8Q8R4D1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
Slc9a8Q8R4D1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Slc9a8Q8R4D1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Slc9a8Q8R4D1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Slc9a8Q8R4D1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Slc9a8Q8R4D1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Slc9a8Q8R4D1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Slc9a8Q8R4D1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22,78■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22,77■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22,77■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Slc9a8Q8R4D1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Slc9a8Q8R4D1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22,76■■□□□ 1,23
Slc9a8Q8R4D1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Slc9a8Q8R4D1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22,76■■□□□ 1,23
Slc9a8Q8R4D1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Slc9a8Q8R4D1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42,2 ms