Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv3Q8K424 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv3Q8K424 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv3Q8K424 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpv3Q8K424 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpv3Q8K424 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv3Q8K424 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trpv3Q8K424 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpv3Q8K424 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpv3Q8K424 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpv3Q8K424 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpv3Q8K424 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpv3Q8K424 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpv3Q8K424 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpv3Q8K424 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpv3Q8K424 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpv3Q8K424 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpv3Q8K424 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpv3Q8K424 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpv3Q8K424 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpv3Q8K424 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpv3Q8K424 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpv3Q8K424 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpv3Q8K424 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpv3Q8K424 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpv3Q8K424 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpv3Q8K424 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpv3Q8K424 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpv3Q8K424 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpv3Q8K424 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpv3Q8K424 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpv3Q8K424 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpv3Q8K424 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpv3Q8K424 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpv3Q8K424 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpv3Q8K424 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpv3Q8K424 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpv3Q8K424 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpv3Q8K424 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpv3Q8K424 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpv3Q8K424 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv3Q8K424 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv3Q8K424 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv3Q8K424 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpv3Q8K424 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpv3Q8K424 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpv3Q8K424 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpv3Q8K424 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpv3Q8K424 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpv3Q8K424 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpv3Q8K424 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpv3Q8K424 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpv3Q8K424 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpv3Q8K424 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpv3Q8K424 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpv3Q8K424 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpv3Q8K424 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpv3Q8K424 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpv3Q8K424 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpv3Q8K424 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpv3Q8K424 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpv3Q8K424 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms