Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T4

Uqcc3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uqcc3Q8K2T4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uqcc3Q8K2T4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uqcc3Q8K2T4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uqcc3Q8K2T4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Uqcc3Q8K2T4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uqcc3Q8K2T4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uqcc3Q8K2T4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uqcc3Q8K2T4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uqcc3Q8K2T4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uqcc3Q8K2T4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uqcc3Q8K2T4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uqcc3Q8K2T4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Uqcc3Q8K2T4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Uqcc3Q8K2T4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Uqcc3Q8K2T4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uqcc3Q8K2T4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uqcc3Q8K2T4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uqcc3Q8K2T4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uqcc3Q8K2T4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uqcc3Q8K2T4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms