Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gin1Q8K259 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gin1Q8K259 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gin1Q8K259 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gin1Q8K259 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gin1Q8K259 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gin1Q8K259 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gin1Q8K259 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gin1Q8K259 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gin1Q8K259 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gin1Q8K259 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gin1Q8K259 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gin1Q8K259 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gin1Q8K259 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gin1Q8K259 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gin1Q8K259 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gin1Q8K259 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gin1Q8K259 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gin1Q8K259 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gin1Q8K259 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gin1Q8K259 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gin1Q8K259 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gin1Q8K259 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gin1Q8K259 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gin1Q8K259 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gin1Q8K259 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gin1Q8K259 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gin1Q8K259 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gin1Q8K259 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gin1Q8K259 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gin1Q8K259 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gin1Q8K259 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gin1Q8K259 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gin1Q8K259 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gin1Q8K259 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms