Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pacs1Q8K212 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pacs1Q8K212 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pacs1Q8K212 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pacs1Q8K212 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pacs1Q8K212 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pacs1Q8K212 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pacs1Q8K212 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pacs1Q8K212 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pacs1Q8K212 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pacs1Q8K212 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pacs1Q8K212 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pacs1Q8K212 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pacs1Q8K212 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pacs1Q8K212 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacs1Q8K212 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacs1Q8K212 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacs1Q8K212 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pacs1Q8K212 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pacs1Q8K212 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pacs1Q8K212 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pacs1Q8K212 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pacs1Q8K212 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pacs1Q8K212 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pacs1Q8K212 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pacs1Q8K212 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pacs1Q8K212 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pacs1Q8K212 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pacs1Q8K212 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pacs1Q8K212 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pacs1Q8K212 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pacs1Q8K212 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pacs1Q8K212 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pacs1Q8K212 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pacs1Q8K212 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pacs1Q8K212 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pacs1Q8K212 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pacs1Q8K212 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pacs1Q8K212 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pacs1Q8K212 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pacs1Q8K212 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pacs1Q8K212 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pacs1Q8K212 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pacs1Q8K212 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pacs1Q8K212 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacs1Q8K212 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacs1Q8K212 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacs1Q8K212 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pacs1Q8K212 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pacs1Q8K212 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pacs1Q8K212 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pacs1Q8K212 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pacs1Q8K212 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pacs1Q8K212 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pacs1Q8K212 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pacs1Q8K212 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pacs1Q8K212 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pacs1Q8K212 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pacs1Q8K212 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pacs1Q8K212 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pacs1Q8K212 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pacs1Q8K212 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pacs1Q8K212 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pacs1Q8K212 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pacs1Q8K212 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pacs1Q8K212 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pacs1Q8K212 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pacs1Q8K212 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pacs1Q8K212 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 241.5 ms