Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc47a1Q8K0H1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc47a1Q8K0H1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc47a1Q8K0H1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc47a1Q8K0H1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc47a1Q8K0H1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc47a1Q8K0H1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc47a1Q8K0H1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc47a1Q8K0H1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc47a1Q8K0H1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc47a1Q8K0H1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc47a1Q8K0H1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc47a1Q8K0H1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc47a1Q8K0H1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc47a1Q8K0H1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc47a1Q8K0H1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc47a1Q8K0H1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc47a1Q8K0H1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc47a1Q8K0H1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc47a1Q8K0H1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc47a1Q8K0H1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc47a1Q8K0H1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc47a1Q8K0H1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc47a1Q8K0H1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc47a1Q8K0H1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc47a1Q8K0H1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc47a1Q8K0H1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc47a1Q8K0H1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc47a1Q8K0H1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc47a1Q8K0H1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc47a1Q8K0H1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc47a1Q8K0H1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc47a1Q8K0H1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc47a1Q8K0H1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc47a1Q8K0H1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc47a1Q8K0H1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc47a1Q8K0H1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc47a1Q8K0H1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc47a1Q8K0H1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc47a1Q8K0H1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc47a1Q8K0H1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc47a1Q8K0H1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc47a1Q8K0H1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc47a1Q8K0H1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc47a1Q8K0H1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc47a1Q8K0H1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc47a1Q8K0H1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc47a1Q8K0H1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc47a1Q8K0H1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc47a1Q8K0H1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc47a1Q8K0H1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc47a1Q8K0H1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc47a1Q8K0H1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc47a1Q8K0H1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms