Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHS2

Dnajc22, DnaJ homolog subfamily C member 22, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc22Q8CHS2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnajc22Q8CHS2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajc22Q8CHS2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajc22Q8CHS2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnajc22Q8CHS2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc22Q8CHS2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc22Q8CHS2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnajc22Q8CHS2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajc22Q8CHS2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnajc22Q8CHS2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajc22Q8CHS2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnajc22Q8CHS2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajc22Q8CHS2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnajc22Q8CHS2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnajc22Q8CHS2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc22Q8CHS2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc22Q8CHS2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc22Q8CHS2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc22Q8CHS2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc22Q8CHS2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc22Q8CHS2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc22Q8CHS2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc22Q8CHS2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc22Q8CHS2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc22Q8CHS2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc22Q8CHS2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajc22Q8CHS2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajc22Q8CHS2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc22Q8CHS2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc22Q8CHS2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc22Q8CHS2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc22Q8CHS2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc22Q8CHS2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc22Q8CHS2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc22Q8CHS2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc22Q8CHS2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc22Q8CHS2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc22Q8CHS2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc22Q8CHS2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnajc22Q8CHS2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnajc22Q8CHS2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc22Q8CHS2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc22Q8CHS2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc22Q8CHS2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc22Q8CHS2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc22Q8CHS2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc22Q8CHS2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc22Q8CHS2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc22Q8CHS2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc22Q8CHS2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc22Q8CHS2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc22Q8CHS2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc22Q8CHS2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnajc22Q8CHS2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc22Q8CHS2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc22Q8CHS2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc22Q8CHS2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc22Q8CHS2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc22Q8CHS2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc22Q8CHS2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc22Q8CHS2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc22Q8CHS2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc22Q8CHS2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc22Q8CHS2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc22Q8CHS2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc22Q8CHS2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajc22Q8CHS2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms