Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHQ0

Fbxo4, F-box only protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo4Q8CHQ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo4Q8CHQ0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo4Q8CHQ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo4Q8CHQ0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo4Q8CHQ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo4Q8CHQ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo4Q8CHQ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo4Q8CHQ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo4Q8CHQ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo4Q8CHQ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo4Q8CHQ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo4Q8CHQ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo4Q8CHQ0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo4Q8CHQ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Fbxo4Q8CHQ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo4Q8CHQ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo4Q8CHQ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo4Q8CHQ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo4Q8CHQ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo4Q8CHQ0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo4Q8CHQ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo4Q8CHQ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo4Q8CHQ0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo4Q8CHQ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo4Q8CHQ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo4Q8CHQ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo4Q8CHQ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo4Q8CHQ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo4Q8CHQ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo4Q8CHQ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo4Q8CHQ0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo4Q8CHQ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo4Q8CHQ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo4Q8CHQ0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo4Q8CHQ0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo4Q8CHQ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo4Q8CHQ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo4Q8CHQ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo4Q8CHQ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo4Q8CHQ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo4Q8CHQ0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo4Q8CHQ0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fbxo4Q8CHQ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo4Q8CHQ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo4Q8CHQ0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo4Q8CHQ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo4Q8CHQ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms