Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hpf1Q8CFE2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hpf1Q8CFE2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hpf1Q8CFE2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hpf1Q8CFE2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hpf1Q8CFE2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hpf1Q8CFE2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hpf1Q8CFE2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hpf1Q8CFE2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hpf1Q8CFE2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hpf1Q8CFE2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hpf1Q8CFE2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hpf1Q8CFE2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hpf1Q8CFE2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hpf1Q8CFE2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hpf1Q8CFE2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hpf1Q8CFE2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hpf1Q8CFE2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hpf1Q8CFE2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hpf1Q8CFE2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hpf1Q8CFE2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hpf1Q8CFE2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hpf1Q8CFE2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hpf1Q8CFE2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hpf1Q8CFE2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hpf1Q8CFE2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hpf1Q8CFE2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hpf1Q8CFE2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hpf1Q8CFE2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hpf1Q8CFE2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hpf1Q8CFE2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hpf1Q8CFE2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hpf1Q8CFE2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hpf1Q8CFE2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hpf1Q8CFE2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hpf1Q8CFE2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hpf1Q8CFE2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hpf1Q8CFE2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hpf1Q8CFE2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hpf1Q8CFE2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hpf1Q8CFE2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hpf1Q8CFE2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hpf1Q8CFE2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hpf1Q8CFE2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hpf1Q8CFE2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hpf1Q8CFE2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hpf1Q8CFE2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hpf1Q8CFE2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hpf1Q8CFE2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hpf1Q8CFE2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hpf1Q8CFE2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hpf1Q8CFE2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hpf1Q8CFE2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hpf1Q8CFE2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hpf1Q8CFE2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hpf1Q8CFE2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms