Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx8Q8CFD4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx8Q8CFD4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx8Q8CFD4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx8Q8CFD4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx8Q8CFD4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx8Q8CFD4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx8Q8CFD4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx8Q8CFD4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx8Q8CFD4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx8Q8CFD4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx8Q8CFD4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx8Q8CFD4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx8Q8CFD4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Snx8Q8CFD4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx8Q8CFD4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx8Q8CFD4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx8Q8CFD4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx8Q8CFD4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx8Q8CFD4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx8Q8CFD4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx8Q8CFD4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx8Q8CFD4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx8Q8CFD4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx8Q8CFD4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx8Q8CFD4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx8Q8CFD4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx8Q8CFD4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx8Q8CFD4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx8Q8CFD4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx8Q8CFD4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx8Q8CFD4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx8Q8CFD4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx8Q8CFD4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx8Q8CFD4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx8Q8CFD4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx8Q8CFD4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx8Q8CFD4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx8Q8CFD4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx8Q8CFD4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx8Q8CFD4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx8Q8CFD4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx8Q8CFD4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx8Q8CFD4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx8Q8CFD4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx8Q8CFD4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx8Q8CFD4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx8Q8CFD4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx8Q8CFD4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx8Q8CFD4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx8Q8CFD4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
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