Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx16Q8C080 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx16Q8C080 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx16Q8C080 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx16Q8C080 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx16Q8C080 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx16Q8C080 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx16Q8C080 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx16Q8C080 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx16Q8C080 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx16Q8C080 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx16Q8C080 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx16Q8C080 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx16Q8C080 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx16Q8C080 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx16Q8C080 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx16Q8C080 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx16Q8C080 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx16Q8C080 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx16Q8C080 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx16Q8C080 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx16Q8C080 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx16Q8C080 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx16Q8C080 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx16Q8C080 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx16Q8C080 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx16Q8C080 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx16Q8C080 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx16Q8C080 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx16Q8C080 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx16Q8C080 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx16Q8C080 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx16Q8C080 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx16Q8C080 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx16Q8C080 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx16Q8C080 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx16Q8C080 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx16Q8C080 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx16Q8C080 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx16Q8C080 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx16Q8C080 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx16Q8C080 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx16Q8C080 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx16Q8C080 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx16Q8C080 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx16Q8C080 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx16Q8C080 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx16Q8C080 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx16Q8C080 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx16Q8C080 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx16Q8C080 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx16Q8C080 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx16Q8C080 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx16Q8C080 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx16Q8C080 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx16Q8C080 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx16Q8C080 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx16Q8C080 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx16Q8C080 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx16Q8C080 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx16Q8C080 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx16Q8C080 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx16Q8C080 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx16Q8C080 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx16Q8C080 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx16Q8C080 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx16Q8C080 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx16Q8C080 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx16Q8C080 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx16Q8C080 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx16Q8C080 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms