Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Kdm4aQ8BW72 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Kdm4aQ8BW72 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Kdm4aQ8BW72 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Kdm4aQ8BW72 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Kdm4aQ8BW72 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Kdm4aQ8BW72 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Kdm4aQ8BW72 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Kdm4aQ8BW72 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Kdm4aQ8BW72 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Kdm4aQ8BW72 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Kdm4aQ8BW72 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Kdm4aQ8BW72 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Kdm4aQ8BW72 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,3
Kdm4aQ8BW72 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Kdm4aQ8BW72 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Kdm4aQ8BW72 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Kdm4aQ8BW72 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Kdm4aQ8BW72 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Kdm4aQ8BW72 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Kdm4aQ8BW72 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Kdm4aQ8BW72 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Kdm4aQ8BW72 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Kdm4aQ8BW72 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,29
Kdm4aQ8BW72 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Kdm4aQ8BW72 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Kdm4aQ8BW72 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Kdm4aQ8BW72 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Kdm4aQ8BW72 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Kdm4aQ8BW72 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Kdm4aQ8BW72 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Kdm4aQ8BW72 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Kdm4aQ8BW72 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Kdm4aQ8BW72 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Kdm4aQ8BW72 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Kdm4aQ8BW72 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Kdm4aQ8BW72 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Kdm4aQ8BW72 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Kdm4aQ8BW72 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Kdm4aQ8BW72 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Kdm4aQ8BW72 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Kdm4aQ8BW72 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
Kdm4aQ8BW72 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Kdm4aQ8BW72 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Kdm4aQ8BW72 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Kdm4aQ8BW72 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Kdm4aQ8BW72 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Kdm4aQ8BW72 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Kdm4aQ8BW72 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Kdm4aQ8BW72 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Kdm4aQ8BW72 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Kdm4aQ8BW72 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Kdm4aQ8BW72 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Kdm4aQ8BW72 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Kdm4aQ8BW72 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Kdm4aQ8BW72 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Kdm4aQ8BW72 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Kdm4aQ8BW72 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Kdm4aQ8BW72 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,25
Kdm4aQ8BW72 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Kdm4aQ8BW72 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Kdm4aQ8BW72 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Kdm4aQ8BW72 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Kdm4aQ8BW72 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Kdm4aQ8BW72 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Kdm4aQ8BW72 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Kdm4aQ8BW72 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Kdm4aQ8BW72 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Kdm4aQ8BW72 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Kdm4aQ8BW72 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,24
Kdm4aQ8BW72 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Kdm4aQ8BW72 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Kdm4aQ8BW72 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Kdm4aQ8BW72 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Kdm4aQ8BW72 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Kdm4aQ8BW72 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Kdm4aQ8BW72 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Kdm4aQ8BW72 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Kdm4aQ8BW72 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Kdm4aQ8BW72 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Kdm4aQ8BW72 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Kdm4aQ8BW72 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Kdm4aQ8BW72 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Kdm4aQ8BW72 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Kdm4aQ8BW72 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,1 ms