Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab11fip4Q8BQP8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab11fip4Q8BQP8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab11fip4Q8BQP8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab11fip4Q8BQP8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab11fip4Q8BQP8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab11fip4Q8BQP8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rab11fip4Q8BQP8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rab11fip4Q8BQP8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rab11fip4Q8BQP8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab11fip4Q8BQP8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab11fip4Q8BQP8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab11fip4Q8BQP8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab11fip4Q8BQP8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab11fip4Q8BQP8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab11fip4Q8BQP8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab11fip4Q8BQP8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab11fip4Q8BQP8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab11fip4Q8BQP8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab11fip4Q8BQP8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab11fip4Q8BQP8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab11fip4Q8BQP8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab11fip4Q8BQP8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab11fip4Q8BQP8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab11fip4Q8BQP8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab11fip4Q8BQP8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab11fip4Q8BQP8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab11fip4Q8BQP8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab11fip4Q8BQP8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rab11fip4Q8BQP8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rab11fip4Q8BQP8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab11fip4Q8BQP8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab11fip4Q8BQP8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rab11fip4Q8BQP8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab11fip4Q8BQP8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab11fip4Q8BQP8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab11fip4Q8BQP8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rab11fip4Q8BQP8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rab11fip4Q8BQP8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rab11fip4Q8BQP8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rab11fip4Q8BQP8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rab11fip4Q8BQP8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rab11fip4Q8BQP8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rab11fip4Q8BQP8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rab11fip4Q8BQP8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rab11fip4Q8BQP8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rab11fip4Q8BQP8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab11fip4Q8BQP8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab11fip4Q8BQP8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab11fip4Q8BQP8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab11fip4Q8BQP8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab11fip4Q8BQP8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab11fip4Q8BQP8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab11fip4Q8BQP8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rab11fip4Q8BQP8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms