Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gtf3c2Q8BL74 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gtf3c2Q8BL74 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf3c2Q8BL74 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf3c2Q8BL74 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf3c2Q8BL74 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf3c2Q8BL74 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf3c2Q8BL74 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf3c2Q8BL74 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf3c2Q8BL74 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gtf3c2Q8BL74 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf3c2Q8BL74 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf3c2Q8BL74 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf3c2Q8BL74 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf3c2Q8BL74 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf3c2Q8BL74 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf3c2Q8BL74 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf3c2Q8BL74 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf3c2Q8BL74 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf3c2Q8BL74 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf3c2Q8BL74 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf3c2Q8BL74 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf3c2Q8BL74 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf3c2Q8BL74 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf3c2Q8BL74 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf3c2Q8BL74 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf3c2Q8BL74 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf3c2Q8BL74 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf3c2Q8BL74 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf3c2Q8BL74 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf3c2Q8BL74 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf3c2Q8BL74 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf3c2Q8BL74 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf3c2Q8BL74 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf3c2Q8BL74 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gtf3c2Q8BL74 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf3c2Q8BL74 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf3c2Q8BL74 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c2Q8BL74 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c2Q8BL74 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf3c2Q8BL74 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf3c2Q8BL74 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c2Q8BL74 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf3c2Q8BL74 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c2Q8BL74 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c2Q8BL74 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c2Q8BL74 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c2Q8BL74 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c2Q8BL74 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf3c2Q8BL74 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c2Q8BL74 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c2Q8BL74 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gtf3c2Q8BL74 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf3c2Q8BL74 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf3c2Q8BL74 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf3c2Q8BL74 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf3c2Q8BL74 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf3c2Q8BL74 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf3c2Q8BL74 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf3c2Q8BL74 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf3c2Q8BL74 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf3c2Q8BL74 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf3c2Q8BL74 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf3c2Q8BL74 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf3c2Q8BL74 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf3c2Q8BL74 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf3c2Q8BL74 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf3c2Q8BL74 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf3c2Q8BL74 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf3c2Q8BL74 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf3c2Q8BL74 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c2Q8BL74 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms