Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gabra5Q8BHJ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabra5Q8BHJ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabra5Q8BHJ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabra5Q8BHJ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabra5Q8BHJ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gabra5Q8BHJ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gabra5Q8BHJ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gabra5Q8BHJ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gabra5Q8BHJ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gabra5Q8BHJ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gabra5Q8BHJ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gabra5Q8BHJ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gabra5Q8BHJ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gabra5Q8BHJ7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gabra5Q8BHJ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gabra5Q8BHJ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gabra5Q8BHJ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gabra5Q8BHJ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gabra5Q8BHJ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gabra5Q8BHJ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gabra5Q8BHJ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gabra5Q8BHJ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gabra5Q8BHJ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gabra5Q8BHJ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gabra5Q8BHJ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabra5Q8BHJ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabra5Q8BHJ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabra5Q8BHJ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabra5Q8BHJ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabra5Q8BHJ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabra5Q8BHJ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gabra5Q8BHJ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gabra5Q8BHJ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gabra5Q8BHJ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gabra5Q8BHJ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gabra5Q8BHJ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gabra5Q8BHJ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabra5Q8BHJ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabra5Q8BHJ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gabra5Q8BHJ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gabra5Q8BHJ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gabra5Q8BHJ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gabra5Q8BHJ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabra5Q8BHJ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabra5Q8BHJ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabra5Q8BHJ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabra5Q8BHJ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabra5Q8BHJ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabra5Q8BHJ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gabra5Q8BHJ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gabra5Q8BHJ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gabra5Q8BHJ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gabra5Q8BHJ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gabra5Q8BHJ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabra5Q8BHJ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabra5Q8BHJ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabra5Q8BHJ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gabra5Q8BHJ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabra5Q8BHJ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabra5Q8BHJ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabra5Q8BHJ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabra5Q8BHJ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabra5Q8BHJ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabra5Q8BHJ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabra5Q8BHJ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabra5Q8BHJ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabra5Q8BHJ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabra5Q8BHJ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabra5Q8BHJ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms