Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD8

Pcmtd2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd2Q8BHD8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcmtd2Q8BHD8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcmtd2Q8BHD8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcmtd2Q8BHD8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcmtd2Q8BHD8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcmtd2Q8BHD8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcmtd2Q8BHD8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcmtd2Q8BHD8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcmtd2Q8BHD8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcmtd2Q8BHD8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcmtd2Q8BHD8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcmtd2Q8BHD8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcmtd2Q8BHD8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcmtd2Q8BHD8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcmtd2Q8BHD8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcmtd2Q8BHD8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcmtd2Q8BHD8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcmtd2Q8BHD8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcmtd2Q8BHD8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcmtd2Q8BHD8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcmtd2Q8BHD8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcmtd2Q8BHD8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcmtd2Q8BHD8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcmtd2Q8BHD8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcmtd2Q8BHD8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcmtd2Q8BHD8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcmtd2Q8BHD8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcmtd2Q8BHD8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcmtd2Q8BHD8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcmtd2Q8BHD8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcmtd2Q8BHD8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcmtd2Q8BHD8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcmtd2Q8BHD8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcmtd2Q8BHD8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcmtd2Q8BHD8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcmtd2Q8BHD8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcmtd2Q8BHD8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcmtd2Q8BHD8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcmtd2Q8BHD8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcmtd2Q8BHD8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcmtd2Q8BHD8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcmtd2Q8BHD8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcmtd2Q8BHD8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcmtd2Q8BHD8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcmtd2Q8BHD8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcmtd2Q8BHD8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcmtd2Q8BHD8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcmtd2Q8BHD8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcmtd2Q8BHD8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcmtd2Q8BHD8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcmtd2Q8BHD8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcmtd2Q8BHD8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms