Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD8

Pcmtd2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd2Q8BHD8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Pcmtd2Q8BHD8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Pcmtd2Q8BHD8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Pcmtd2Q8BHD8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Pcmtd2Q8BHD8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Pcmtd2Q8BHD8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Pcmtd2Q8BHD8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Pcmtd2Q8BHD8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
Pcmtd2Q8BHD8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Pcmtd2Q8BHD8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Pcmtd2Q8BHD8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Pcmtd2Q8BHD8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Pcmtd2Q8BHD8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Pcmtd2Q8BHD8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Pcmtd2Q8BHD8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Pcmtd2Q8BHD8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Pcmtd2Q8BHD8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Pcmtd2Q8BHD8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Pcmtd2Q8BHD8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Pcmtd2Q8BHD8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Pcmtd2Q8BHD8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Pcmtd2Q8BHD8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Pcmtd2Q8BHD8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Pcmtd2Q8BHD8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Pcmtd2Q8BHD8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Pcmtd2Q8BHD8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Pcmtd2Q8BHD8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Pcmtd2Q8BHD8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Pcmtd2Q8BHD8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Pcmtd2Q8BHD8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Pcmtd2Q8BHD8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Pcmtd2Q8BHD8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Pcmtd2Q8BHD8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Pcmtd2Q8BHD8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Pcmtd2Q8BHD8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Pcmtd2Q8BHD8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Pcmtd2Q8BHD8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Pcmtd2Q8BHD8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Pcmtd2Q8BHD8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Pcmtd2Q8BHD8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Pcmtd2Q8BHD8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Pcmtd2Q8BHD8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Pcmtd2Q8BHD8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Pcmtd2Q8BHD8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Pcmtd2Q8BHD8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Pcmtd2Q8BHD8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Pcmtd2Q8BHD8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Pcmtd2Q8BHD8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Pcmtd2Q8BHD8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Pcmtd2Q8BHD8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Pcmtd2Q8BHD8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Pcmtd2Q8BHD8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms